В отличие от мышечной дистрофии Дюшенна (МДД), при которой дистрофин отсутствует, при Мышечной дистрофии Беккера (МДБ) дистрофин присутствует, но в меньшем количестве, и он отличается от нормального белка, поэтому его «функции» изменены. МДБ вызывается мутациями в гене дистрофина, расположенном на Х-хромосоме. Они приводят как к уменьшению количества дистрофина в мышцах, так и к модификациям самого белка, таким образом, вызывая как количественные, так и качественные изменения в белке.
МДБ встречается в несколько раз реже, чем миодистрофия Дюшенна, мутации, как правило, без нарушения рамки считывания. Клиническая картина заболевания легче, чем МДД, симптомы мышечной дисфункции появляются позже, способность ходить сохраняется до взрослого возраста, иногда до конца жизни, продолжительность жизни чаще обычная. Гораздо чаще и раньше, чем при МДД, встречается патология сердца. Геннаая терапия, которая разработана для МДД и отсутствия белка дистрофина, не подходит пациентам с МДБ.